Svet zavoda ima štiriletni mandat. Sestavlja ga 11 članov, in sicer:
- trije predstavniki staršev
(Alojz Gobec, Milena Marinšek, Saša Ogrizek),
- trije predstavniki ustanovitelja
(Ivan Žaberl, Benja Krulec Vidovič, Miran Koštomaj),
- pet predstavnikov delavcev šole
(Maja Rataj, Klavdija Dimec Govedič, Vesna Drofenik Jerič, Monika Pilko, Miha Čokl).
Predsednica Sveta zavoda OŠ Šmarje pri Jelšah je Maja Rataj.
Pedagoški vodja in poslovodni organ Osnovne šole Šmarje pri Jelšah je ravnatelj Mitja Šket.
Učiteljski zbor sestavljajo učiteljice in učitelji, svetovalne delavke, knjižničarki in organizator informacijskih dejavnosti.
Oddelčni učiteljski zbor sestavljajo učiteljice in učitelji, ki poučujejo v oddelkih posameznih razredov.
Razrednik skrbi za delo v oddelku, analizira učne in vzgojne rezultate v oddelku, sodeluje s starši in odloča o vzgojnih ukrepih.
Strokovne aktive sestavljajo učiteljice in učitelji posameznih razredov in predmetnih skupin.
